为表达对四川汶川大地震遇难同胞的深切哀悼，5月19日中午14时28分，拉萨海关全体干部职工集体默哀3分钟，并下半旗致哀。此外，为积极支持受灾人民的生活，拉萨海关在第一次捐款28850元的基础上，再次组织第二次捐款活动，所有捐款人员倾囊捐助，用实际行动支持四川受灾群众，  截止目前178人共计捐款110061 元（此数目不是最终数字，一些关员正继续捐钱），平均每人捐款618.32元。在此次捐款过程中，不仅有拉萨海关的干部而且还有在拉萨海关机关食堂工作的普通工人，此外还有收入较低的临时工和出差途径拉萨的隶属海关的工人。一位在拉萨海关工作的名叫郑青玉的清洁工，家境贫寒，负担较重，工作兢兢业业，默默无闻，不为人所知，然而在听到拉萨海关要举行捐助四川灾区活动后（拉萨海关没有通知其本人，其自发捐款），将自己平时卖报纸、卖易拉罐的几沓一毛钱共计236元，全部捐给灾区。一位名叫塔曲的藏族临时工人，一个月工资不到千元，为供儿子上学省吃俭用，平时不舍得花一分钱，此次听说四川发生大地震后，他捐献100元钱，他说：我没有多少钱，但我是一名老共产党员，国家有难、匹夫有责，藏汉一家亲，这次四川同胞受难，我非常难受，希望四川受灾群众坚强、坚持、奋发，相信在党中央的领导下，全国人民的共同努力下，四川人民一定可以重建家园。这样的事迹还很多，一位在拉萨出差的拉萨海关隶属聂拉木海关的藏族司机阿旺，在听说举行此次捐款活动后，毅然捐助1000元钱，帮助受灾群众。

为更好地支援灾区，充分发挥海关职能，按照海关总署部署，拉萨海关将为进境的救灾物资和载运救灾物资的运输工具提供通关便利，加速验放，设立专门的抗灾物资报关窗口，实行24小时通关服务。对进境的救灾物资，可凭民政部、国家地震局及省级部门出具的证明先予登记放行，后补办手续，尽最大努力使救灾物资及时运抵灾区。对进出境的救灾、医疗队及专家，以及随身携带的救护医疗设备也将给予通关便利并快速验放。